Instytut Biologii

Zakład Mikrobiologii i Parazytologii

Publikacje Artykuły naukowe (od 2015 roku) Gonciarz w, Lechowicz Ł, Urbaniak M, Kaca W, Chmiela M (2020) Attenuated Total Reflectance Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR) and Artificial Neural Networks Applied to Investigate Quantitative Changes of Selected Soluble Biomarkers, Correlated with H. pylori Infection in Children and Presumable Consequent Delayed Growth. Journal of Clinical Medicine. 9, 3852. DOI: 10.3390/jcm9123852 Kłosowski S, Pawlikowski P, Jabłońska E, Podgórska M (2020) Habitat conditions of the Salvinia natans phytocoenoses in the Vistula and Odra river valleys in Poland. Tuexenia 40:327-344. Durlik K, Czerwonka G, Żarnowiec P, Kaca W. (2019) Characterization of Proteus mirabilis Lipopolysaccharide Samples by Infrared Spectroscopy and Serological Methods. In: Pearson M. (eds) Proteus mirabilis. Methods in Molecular Biology, vol 2021. Humana, New York, NY Matuska-Łyżwa J, Żeber-Dzikowska I, Gworek B, Chmielewski J (2019) Nicienie jako wskaźnik zanieczyszczenia gleb ołowiem na terenach uprzemysłowionych. Przemysł chemiczny. 98(6): 980-985, ISSN 0033-2496, e-ISSN 2449-9951 Marcinkowska M, Puchała A, Matuska-Łyżwa J, Żeber-Dzikowska I, Wójtowicz B, Gworek B, Chmielewski J (2019) Zasady zielonej chemii w preparatyce eterów 4,4’-bifenolu. Przemysł chemiczny. 98(4):551-555, ISSN 0033-2496, e-ISSN 2449-9951 Rogala P, Czerwonka G, Michalkiewicz S, Hodorowicz M, Barszcz B, Jablonska-Wawrzycka A. (2019) Synthesis, Structural Characterization and Antimicrobial Evaluation of Ruthenium Complexes with Heteroaromatic Carboxylic Acids. Chemistry & Biodiversity. DOI: 10.1002/cbdv.201900403. Gmiter D, Czerwonka G, Drewnowska JM, Swiecicka I, Kaca W. (2019) Draft genome sequences of Proteus mirabilis K1609 and K670: A model strains for territoriality examination. Current Microbiology. DOI: 10.1007/s00284-018-1598-6. Czerwonka G, Gmiter D, Guzy A, Rogala P, Jablonska-Wawrzycka A, Borkowski A, Clapa T, Narozna D, Kowalczyk P, Syczewski M, Drabik M, Danczuk M, Kaca, W. (2019) A benzimidazole-based ruthenium(IV) complex inhibits Pseudomonas aeruginosa biofilm formation by interacting with siderophores and the cell envelope, and inducing oxidative stress. Biofouling. DOI: 10.1080/08927014.2018.1564818. Kamizela A, Gawdzik B, Urbaniak M, Lechowicz L, Bialonska A, Kutniewska SE, Gonciarz W, Chmiela M. (2019) New gamma-Halo-delta-lactones and delta-Hydroxy-gamma lactones with Strong Cytotoxic Activity. Molecules. DOI: 10.3390/molecules24101875. Ura-Binczyk E, Banas J, Mazurkiewicz B, Solarski W, Lewandowska M, Roguska A, Andrzejczuk M, Balcer M, Kulik S, Zarnowiec P, Kaca W. (2019) On-site monitoring and laboratory characterization of corrosion processes in the geothermal water of Polish Lowland. Geothermics. DOI: 10.1016/j.geothermics.2018.10.002. Kaca W, Nowak M, Czerwonka G. (2018) Comparison of genomes of Pseudomonas aeruginosa strains by using chaos game representation. Int J Biomed Data Min. DOI: 10.4172/2090-4924.1000132. Borkowski A, Gutowski Ł, Syczewski M, Cłapa T, Czerwonka G. (2018) Adaptation of bacteria Escherichia coli in presence of quaternary ammonium ionic liquids. Ecotoxicol Environ Saf. DOI: 10.1016/j.ecoenv.2018.08.048. Gmiter D, Czerwonka G, Kaca W. (2018) Type Vb and Vi secretion systems as competition agents of Gram-negative bacteria. Postep. Mikrobiol. 4 (57), 360-373. Kowalczyk P, Borkowski A, Czerwonka G, Clapa T, Ciesla J, Misiewicz A, Borowiec M, Szala M. (2018) The microbial toxicity of quaternary ammonium ionic liquids is dependent on the type of lipopolysaccharide. J Mol Liq. DOI: 10.1016/j.molliq.2018.06.102. Kaminski ZJ, Relich I, Konieczna I, Kaca W, Kolesinska B. (2018) Cross-Reactivity of polyclonal antibodies against Canavalia ensiformis (Jack Bean) urease and Helicobacter pylori urease subunit a fragments. Chem Biodivers. DOI: 10.1002/cbdv.201700444. Kamizela A, Gawdzik B, Urbaniak M, Lechowicz Ł, Białońska A, Gonciarz W, Chmiela M. (2018) Synthesis, characterization, cytotoxicity, and antibacterial properties of trans-γ-Halo-δ-lactones. ChemistryOpen. DOI: 10.1002/open.201800110. Konieczna I, Relich I, Durajski M, Lechowicz L, Chrapek M, Gaweda J, Fraczyk J, Kaminski ZJ. (2018) Novel tool in rheumatoid arthritis diagnosis - The usage of urease flap region peptidomimetics. J Pept Sci. DOI: 10.1002/psc.3084. Gleńska-Olender J, Durlik K, Konieczna I, Kowalska P, Gawęda J, Kaca W. (2017) Detection of human antibodies binding with smooth and rough LPSs from Proteus mirabilis O3 strains S1959, R110, R45. Antonie Van Leeuwenhoek. DOI: 10.1007/s10482-017-0937-0. Borkowski A, Kowalczyk P, Czerwonka G, Ciesla J, Clapa T, Misiewicz A, Szala M, Drabik M. (2017) Interaction of quaternary ammonium ionic liquids with bacterial membranes - Studies with Escherichia coli R1-R4-type lipopolysaccharides. J Mol Liq. DOI: 10.1016/j.molliq.2017.09.074. Czerwonka G, Konieczna I, Żarnowiec P, Zieliński A, Malinowska-Gniewosz A, Gałuszka A, Migaszewski Z, Kaca W. (2017) Characterization of microbial communities in acidified, sulfur containing soils. Pol J Microbiol. DOI: 10.5604/01.3001.0010.7043. Adamus-Białek W, Lechowicz Ł, Kubiak-Szeligowska AB, Wawszczak M, Kamińska E, Chrapek M. (2017) A new look at the drug-resistance investigation of uropathogenic E. coli strains. Mol Biol Rep. DOI: 10.1007/s11033-017-4099-y. Czerwonka G, Guzy A, Kałuża K, Grosicka M, Dańczuk M, Lechowicz Ł, Gmiter D, Kowalczyk P, Kaca W. (2016) The role of Proteus mirabilis cell wall features in biofilm formation. Arch Microbiol. DOI: 10.1007/s00203-016-1249-x. Arabski M, Barabanova A, Gałczyńska K, Węgierek-Ciuk A, Dzidowska K, Augustyniak D, Drulis-Kawa Z, Lankoff A, Yermak I, Molinaro A, Kaca W. (2016) Modification biological activity of S and R forms of Proteus mirabilis and Burkholderia cepacia lipopolysaccharides by carrageenans. Carbohydr Polym. DOI: 10.1016/j.carbpol.2016.04.079. Lechowicz L, Chrapek M, Czerwonka G, Korzeniowska-Kowal A, Tobiasz A, Urbaniak M, Matuska-Lyzwa J, Kaca W. (2016) Detection of ureolytic activity of bacterial strains isolated from entomopathogenic nematodes using infrared spectroscopy. J Basic Microbiol. DOI: 10.1002/jobm.201500538. Zarnowiec P, Mizera A, Chrapek M, Urbaniak M, Kaca W. (2016) Chemometric analysis of attenuated total reflectance infrared spectra of Proteus mirabilis strains with defined structures of LPS. Innate Immun. DOI: 10.1177/1753425916647470. Jablonska-Wawrzycka A, Rogala P, Czerwonka G, Hodorowicz M, Stadnicka K. (2016) Zinc(II) complexes with heterocyclic ether, acid and amide. Crystal structure, spectral, thermal and antibacterial activity studies. J Mol Struct. DOI: 10.1016/j.molstruc.2015.10.067. Lechowicz L, Chrapek M, Gaweda J, Urbaniak M, Konieczna I. (2016) Use of Fourier-transform infrared spectroscopy in the diagnosis of rheumatoid arthritis: a pilot study. Mol Biol Rep. 43(12):1321-1326. Gawdzik, B; Wzorek, A; Lechowicz, L; Urbaniak, M. (2016) Synthesis of New Arylmethylene Derivatives of Resorcinarene via the Catalyzed Mannich Reaction. Synlett. DOI: 10.1055/s-0035-1560702. Cullen L, Weiser R, Olszak T, Maldonado RF, Moreira AS, Slachmuylders L, Brackman G, Paunova-Krasteva TS, Zarnowiec P, Czerwonka G, Reilly J, Drevinek P, Kaca W, Melter O, De Soyza A, Perry A, Winstanley C, Stoitsova SR, Lavigne R, Mahenthiralingam E, Sá-Correia I, Coenye T, Drulis-Kawa Z, Augustyniak D, Valvano MA, McClean S. (2015) Phenotypic characterization of an international Pseudomonas aeruginosa reference panel: strains of cystic fibrosis (CF) origin show less in vivo virulence than non-CF strains. Microbiology. DOI: 10.1099/mic.0.000155. Olszak T, Zarnowiec P, Kaca W, Danis-Wlodarczyk K, Augustyniak D, Drevinek P, de Soyza A, McClean S, Drulis-Kawa Z. (2015) In vitro and in vivo antibacterial activity of environmental bacteriophages against Pseudomonas aeruginosa strains from cystic fibrosis patients. Appl Microbiol Biotechnol. DOI: 10.1007/s00253-015-6492-6. Gleńska-Olender J, Sęk S, Dworecki K, Kaca W. (2015) A total internal reflection ellipsometry and atomic force microscopy study of interactions between Proteus mirabilis lipopolysaccharides and antibodies. Eur Biophys J. DOI: 10.1007/s00249-015-1022-0. Urbaniak M, Gawdzik B, Wzorek A, Kaca W, Lechowicz Ł. (2015) Synthesis and complexing properties of diglycol resorcinarene podands. J Incl Phenom Macrocycl Chem. 81(3-4):357-365. Matuska-Lyzwa J, Kaca W, Zarnowiec P. (2015) Biological activity of wild isolates of entomopathogenic nematodes to horse-chestnut leaf miner (Cameraria ohridella). Pol J Environ Stud. 24 (3), 1181-1184. Adamus-Białek W, Kubiak A, Czerwonka G. (2015) Analysis of uropathogenic Escherichia coli biofilm formation under different growth conditions. Acta Biochim Pol. 62(4):765-71. DOI: 10.18388/abp.2015_1127. Zarnowiec P, Lechowicz Ł, Czerwonka G, Kaca W. (2015) Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR) as a tool for the identification and differentiation of pathogenic bacteria. Curr Med Chem. 22(14):1710-8. Arabski M, Konieczna I, Tusińska E, Wąsik S, Relich I, Zając K, Kamiński ZJ, Kaca W. (2015) The use of lysozyme modified with fluorescein for the detection of Gram-positive bacteria. Microbiol Res. DOI: 10.1016/j.micres.2014.05.004. Monografie i rozdziały w monografiach (od 2020 roku) Stawiarz M., Gmiter D., Kaca W., „Wstępna charakterystyka konkurencji międzygatunkowej szczepów Proteus mirabilis i Pseudomonas aeruginosa" - Czynniki środowiskowe a zdrowie - wymiar edukacyjny, Instytut Ochrony Środowiska - Państwowy Instytut Badawczy, s. 249-260, ISBN 978-83-60312-63-6 Gmiter D., Stawiarz M., Kaca W., „Wpływ plazmidów z grupy niezgodności ColE1 na kinetykę wzrostu i wzrost rozpełzły szczepów Proteus mirabilis" - Czynniki środowiskowe a zdrowie - wymiar edukacyjny, Instytut Ochrony Środowiska - Państwowy Instytut Badawczy, s. 283-292, ISBN 978-83-60312-63-6 Referaty konferencyjne indeksowane w WoS (od 2017 roku) Gonciarz W, Lechowicz L, Konieczna I, Urbaniak M, Kaca W, Chmiela M. (2018) Analysis of serum samples by the infrared spectroscopy (IR) for selection of spectroscopic motives specific to H. pylori infection. Conference: EHMSG 31st International Workshop on Helicobacter and Microbiota in Inflammation and Cancer, 14-15.08.2018, Kaunas, Lithuania. Published: Helicobacter. 23 (1) SI, P01.08. Konieczna I, Lechowicz L, Chrzanowska M, Chyb M, Cholewa S, Grzegorczyk D, Ciura J, Gaweda J. (2018) Drug resistance in bacteria isolated from urine of rheumatoid arthritispatients and induction of resistance by chloroquine. Konferencja/Conference: Congress of the European-League-Against-Rheumatism (EULAR), 13-16.06.2018, Amsterdam, Netherlands. Published: Annals of the rheumatic diseases. DOI: 10.1136/annrheumdis-2018-eular.5607 Komunikaty konferencyjne (od 2017 roku) Durlik K, Domaszko A, Kaca W. (2019) The presence of antibodies against Epstein Barr virus in rheumatoid arthritis patients’ sera; DIAGMOL 2019, 23.11.2019, Warszawa, Poland Durlik K, Żarnowiec P, Piwowarczyk R, Kaca W. (2019) Identification and differentiation of endophytic bacteria from seeds of parasitic Phelipanche ramosa (Orobanchaceae), 8th International Weigl Conference, 26-28.06.2019, Łódź, Poland Durlik K, Żarnowiec P, Lechowicz Ł, Kaca W. (2019) Application of Fourier Transform-Infrared Spectroscopy as a Tool for RA Detection. 8th International Weigl Conference. 26-28.06.2019, Łódź, Poland Petosyan K, Ślusarczyk J. (2019) Plastic products and their impact on the environment and human health. XXVIII Konferencja Studenckich Kół naukowych “Człowiek i jego środowisko”, 11-12.04.2019, Kielce, Poland Trojak M, Ślusarczyk J, Skowron E, Petrosyan K, Kocurek M, Pałyga J. Wpływ zróżnicowanego spektrum świetlnego na morfologię i anatomię liści pomidora zwyczajnego (Solanum lycopersicum L.); Abstracts of Lectures and Posters of the 58th PBS Congress. 58th Congress of the Polish Botanical Society ”Botany without borders”. Ludwik Frey, 2019, Kraków, p.259 [In Polish] Kaca W. (2019) Conference: DIAGMOL 2019, 23.11.2019, Warsaw, Poland Durlik K, Kaca W. (2018) Detection of antibodies binding non-sugar components of Proteus mirabilis lipopolysaccharides from rheumatoid arthritis patients sera. Conference: 8th Baltic Meeting on Microbial Carbohydrates (BMMC), 9-12.09.2018, Dublin, Ireland. Stawiarz M, Gmiter D, Czerwonka G, Kaca W. (2018) The genetic diversity among Dienes incompatible Proteus mirabilis strains. Conference: 4th International Conference of Cell Biology, 11-12.05.2018, Cracow, Poland. Szypnicka G, Gmiter D, Kaca W. (2018) Proteus mirabilis swarming motility in presence of various Gram-negative and Gram-positive bacteria. Conference: 4th International Conference of Cell Biology, 11-12.05.2018, Cracow, Poland. Durlik K, Kaca W. (2017) Rola niecukrowych składników lipopolisacharydów Proteus mirabilis w reakcjach serologicznych z przeciwciałami ludzkimi. Conference: I Forum Doktorantów Wydziału Matematyczno-Przyrodniczego Uniwersytetu Jana Kochanowskiego w Kielcach, 08.06.2017, Kielce, Poland. Prezentacje ustne (od 2017 roku) Durlik K, Żarnowiec P, Kaca W. (2019) Znaczenie amidu kwasu galakturonowego i lizyny w wiązaniu lipopolisacharydów Proteus mirabilis przez przeciwciała surowic chorych na reumatoidalne zapalenie stawów, III Forum Doktorantów Uniwersytetu Jana Kochanowskiego w Kielcach, 11-12.06.2019, Kielce, Poland Gmiter D, Czerwonka G, Durlik K, Żarnowiec P, KacaW. Complete genome sequence of Proteus mirabilis S1959 serogroup O3, Młodzi naukowcy, 22.11.2019, Lublin, Poland Petrosyan K, Piwowarczyk R, Kaca W. (2019) Characteristics of endophyte microbiome of family Orobanchaceae” 3 Forum Doktorantów, 10-11.06.2019, Kielce, Poland Kaca W, Durlik K, Żarnowiec P. (2019) Correlations of Inflammatory Potential of Gram-Negative Bacterial Endotoxins (lipopolysaccharides, LPSs) of Human Microbiome with Bowel Inflammatory and Cancer Diseases. Conference: Innogly 1st Simposium. 23-25.2019, Santiago de Compostela, Spain. Gmiter D, Szypnicka G, Sobczyk P, Kaca W. (2018) Charakterystyka wzrostu rozpełzłego szczepu Proteus mirabilis K39 w obecności bakterii Gram-ujemnych i Gram-dodatnich. Conference: Konferencja Młodzi Naukowcy, 23.11.2018, Lublin, Poland. Gmiter D, Czerwonka G, Drewnowska J, Swiecicka I, Gniadkowski M, Kaca W. (2018) Opracowanie modelu do badania dyskryminacji krewniaczej u Proteus mirabilis. Conference: 2 Forum Doktorantów Wydziału Matematyczno-Przyrodniczego, 12-14.06.2018, Kielce, Poland. Durlik K, Żarnowiec P, Domaszko A, Kaca W. (2018) Wpływ choliny w podłożu na zmianę widma IR Proteus mirabilis O18. Conference: Młodzi naukowcy, 23.11.2018. Durlik K, Kaca W. (2018) Detection of antibodies binding non-sugar components of Proteus mirabilis lipopolysaccharides from rheumatoid arthritis patients sera. Conference: 8th Baltic Meeting on Microbial Carbohydrates (BMMC), 9-12.09. 2018, Dublin, Ireland. Durlik K, Kaca W. (2018) Badanie obecności przeciwciał przeciwko lipopolisacharydom Proteus sp. zawierającym niecukrowe składniki w części polisacharydowej w surowicach pacjentów chorych na reumatoidalne zapalenie stawów. Conference: II Forum Doktorantów Wydziału Matematyczno-Przyrodniczego Uniwersytetu Jana Kochanowskiego w Kielcach, 12-14.06.2018, Kielce; Poland. Uczestnictwo w konferencjach i szkoleniach (od 2020 roku): Kaca W. (2020) Conference: Glycosylation in cancer and tumour Immunology. Porto, Portugalia, 8-9.10.2020 Kaca W., Żarnowiec P. (2020) Training: - Innogly virtual training in glycoanalysis and glycoinformatics. Getebirg, Sweden, 3.11.2020 Wykład na zaproszenie (od 2017 roku) University of Michigan, prof. W. Kaca, Characterization of Proteus mirabilis strains by phenotypic and genetic methods, 25.09.2019. University of Mainz, prof. W. Kaca, Lectures and seminars (Erasmus+), 23.11-1.12.2018.